La Asamblea General es el órgano colectivo principal de la Corporación, integrado por la totalidad de sus socios activos. Es la máxima instancia de decisión y participación institucional.
Actualmente, la Asamblea General está integrada por:

- Asociación de Municipalidades de la Región de Aysén
- Asociación Gremial Cámara de Turismo Aysén Patagonia A.G.
- Distribuidora Las Lechuzas SpA
- Puerto Oxxean Chacabuco
- Compas Marine Trabajos Marítimos S.A.
- Asociación Gremial Consejo del Salmón A.G.
- Asociación Gremial Regional de Guías de Turismo de la Patagonia Aysén
- Comercial Casa Alicia S.A.
- Corporación de Desarrollo Productivo del Litoral Aysén
- Empresas AquaChile S.A.
- Empresa Portuaria Chacabuco