El Directorio es el órgano encargado de dirigir y administrar la Corporación, velando por el cumplimiento de sus estatutos y objetivos.

Está integrado por siete miembros titulares:

a) El Gobernador Regional de Aysén, quien lo preside.
b) Tres directores designados por el Consejo Regional, a proposición del Gobernador Regional.
c) Tres directores elegidos por la Asamblea General de Socios.

El Directorio tiene una duración de dos años en su primer período y de tres años en los períodos sucesivos. Actualmente se encuentra integrado por los siguientes miembros:

• Marcelo Santana Vargas — Presidente
• Arístides Benavente Aninat — Director titular y Vicepresidente provisorio
• Selim Carrasco Lobo — Director titular y Secretario provisorio
• Raúl Enrique Castillo Ceardi — Director titular y Tesorero provisorio
• Rodrigo Canales Alarcón
• Edgardo Avello Manríquez
• Hernán Rebolledo Fernández